Theo kết luận thanh tra, giai đoạn từ ngày 1.1.2012 - 31.3.2017, Phú Yên có 41 dự án đã thực hiện hoặc có nhu cầu phải thực hiện chuyển mục đích sử dụng rừng để thực hiện dự án, với tổng diện tích đất cần thu hồi là 1.341,55 ha. Trong tổng số dự án nêu trên thì có 4 dự án đang triển khai và 37 dự án đã và đang triển khai thu hồi, chuyển đổi mục đích sử dụng 725ha rừng.

Cũng theo Thanh tra Tổng cục Lâm nghiệp, trong quá trình triển khai và thực hiện 39/41 dự án không phù hợp với quy hoạch bảo vệ và phát triển rừng của tỉnh Phú Yên giai đoạn 2011- 2020, là trái quy định của Chính phủ đã ban hành ngày 3.3.2006.

Đặc biệt, tại thời điểm thanh tra đã có 2 dự án chưa được Thủ tướng Chính phủ chấp thuận cho phép chuyển đổi mục đích sử dụng rừng phòng hộ, rừng đặc dụng sang thực hiện dự án. Cụ thể là dự án hầm đường bộ Đèo Cả chưa có quyết định thu hồi đất, chuyển đổi mục đích sử dụng đất, nhưng trên thực tế, nhà đầu tư đã chuyển 37,35ha rừng đặc dụng. Còn tại dự án Nhà máy lọc dầu Vũng Rô được UBND tỉnh Phú Yên ban hành quyết định chuyển mục đích sử dụng 42,35ha rừng trồng sang thực hiện dự án.

Đối với dự án chuyển đổi rừng để chăn nuôi bò thịt chất lượng cao, UBND tỉnh Phú Yên giao cho Công ty CP chăn nuôi Thảo Nguyên Phú Yên thực hiện tại tiểu khu 310 và 311 thuộc Ban Quản lý rừng phòng hộ Sông Hinh (xã Sông Hinh, huyện Sông Hinh, tỉnh Phú Yên) cũng được xác định là trái quy định.